Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX1Q15475 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX1Q15475 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX1Q15475 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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