Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH1Q15438 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYTH1Q15438 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms