Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNN3Q15417 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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