Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BECN1Q14457 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BECN1Q14457 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BECN1Q14457 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BECN1Q14457 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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