Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNGB1Q14028 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CNGB1Q14028 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
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