Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP5Q14008 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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