Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCINQ13939 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCINQ13939 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCINQ13939 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCINQ13939 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCINQ13939 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCINQ13939 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCINQ13939 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCINQ13939 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCINQ13939 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCINQ13939 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCINQ13939 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCINQ13939 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCINQ13939 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCINQ13939 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCINQ13939 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCINQ13939 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCINQ13939 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCINQ13939 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCINQ13939 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCINQ13939 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCINQ13939 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCINQ13939 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCINQ13939 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCINQ13939 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCINQ13939 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCINQ13939 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCINQ13939 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCINQ13939 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCINQ13939 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCINQ13939 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCINQ13939 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCINQ13939 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCINQ13939 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCINQ13939 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCINQ13939 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCINQ13939 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCINQ13939 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCINQ13939 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCINQ13939 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCINQ13939 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCINQ13939 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCINQ13939 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCINQ13939 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCINQ13939 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCINQ13939 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCINQ13939 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCINQ13939 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCINQ13939 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCINQ13939 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCINQ13939 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCINQ13939 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCINQ13939 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCINQ13939 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCINQ13939 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCINQ13939 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCINQ13939 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCINQ13939 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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