Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALCAMQ13740 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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