Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK1Q13546 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK1Q13546 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK1Q13546 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK1Q13546 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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