Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTM1Q13496 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTM1Q13496 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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