Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSAMPQ13449 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSAMPQ13449 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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