Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B2Q13435 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SF3B2Q13435 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B2Q13435 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B2Q13435 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
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