Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IKZF1Q13422 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IKZF1Q13422 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IKZF1Q13422 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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