Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXC1Q12948 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXC1Q12948 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXC1Q12948 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXC1Q12948 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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