Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH17Q12864 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH17Q12864 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH17Q12864 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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