Protein–RNA interactions for Protein: Q08219

RRT8, Outer spore wall protein RRT8, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT8Q08219 ALT1YLR089C 1779 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 OPI7YDR360W 435 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 YGR176WYGR176W 348 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 CAF40YNL288W 1122 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 NOP7YGR103W 1818 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 MCM3YEL032W 2916 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 YFL042CYFL042C 2025 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 YDR015CYDR015C 240 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 COX20YDR231C 618 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 HVG1YER039C 750 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 MDH1YKL085W 1005 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 YPL136WYPL136W 369 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 YTH1YPR107C 627 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT8Q08219 RNR3YIL066C 2610 nt5.65□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 BPL1YDL141W 2073 nt5.65□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 CLB2YPR119W 1476 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 CTS2YDR371W 1536 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 GAT1YFL021W 1533 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 FHL1YPR104C 2811 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 ICL1YER065C 1674 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 MSP1YGR028W 1089 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 FHN1YGR131W 525 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 PUS5YLR165C 765 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 MRPL10YNL284C 969 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 ATG4YNL223W 1485 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 VAN1YML115C 1608 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 RPN11YFR004W 921 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 RPL10YLR075W 666 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 TUL1YKL034W 2277 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 SPC97YHR172W 2472 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 LSG1YGL099W 1923 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 RHO3YIL118W 696 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 YJU3YKL094W 942 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 DRE2YKR071C 1047 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 YMR295CYMR295C 594 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 RRP9YPR137W 1722 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 YDL218WYDL218W 954 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 UTP4YDR324C 2331 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 RPL7AYGL076C 735 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 HAP2YGL237C 798 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 VBA1YMR088C 1689 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 RPL7BYPL198W 735 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 SSK22YCR073C 3996 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 ABZ1YNR033W 2364 nt5.6□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 RAD3YER171W 2337 nt5.6□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 YER186CYER186C 921 nt5.6□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.6□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 FET3YMR058W 1911 nt5.6□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 PTK2YJR059W 2457 nt5.59□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 HSP78YDR258C 2436 nt5.59□□□□□ -1.51
RRT8Q08219 RAD24YER173W 1980 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 KEX2YNL238W 2445 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 AMA1YGR225W 1782 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 PKC1YBL105C 3456 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 PMP3YDR276C 168 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 CTR2YHR175W 570 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 TAL1YLR354C 1008 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YNL285WYNL285W 372 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 DSF1YEL070W 1509 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YNR073CYNR073C 1509 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 NUD1YOR373W 2556 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 PHB1YGR132C 864 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 JNM1YMR294W 1122 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 ENV9YOR246C 993 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 FSF1YOR271C 984 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YPK2YMR104C 2034 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 RPS2YGL123W 765 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 SPG1YGR236C 288 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YKL107WYKL107W 930 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 RNH201YNL072W 924 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 NUP1YOR098C 3231 nt5.55□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.55□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 PDE1YGL248W 1110 nt5.55□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 DJP1YIR004W 1299 nt5.55□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 CIN4YMR138W 576 nt5.55□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.55□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 CLB1YGR108W 1416 nt5.55□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 VPS1YKR001C 2115 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 ERC1YHR032W 1746 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YDL129WYDL129W 876 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YHL018WYHL018W 363 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 RPS5YJR123W 678 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 YNL165WYNL165W 1221 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 SUE1YPR151C 621 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 DIA3YDL024C 1407 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 QRI1YDL103C 1434 nt5.54□□□□□ -1.52
RRT8Q08219 RME1YGR044C 903 nt5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.6 ms