Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNK2Q07912 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNK2Q07912 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms