Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 FRE7YOL152W 1863 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 VTS1YOR359W 1572 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 MAL13YGR288W 1422 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 BRL1YHR036W 1416 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 LAT1YNL071W 1449 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 HIM1YDR317W 1245 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 SKI6YGR195W 741 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 YLR365WYLR365W 333 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 TGS1YPL157W 948 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 SSC1YJR045C 1965 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 RIT1YMR283C 1542 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 GIT1YCR098C 1557 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 HSM3YBR272C 1443 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 PEX19YDL065C 1029 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 YDR282CYDR282C 1245 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 YIP4YGL198W 708 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 CIR1YGR207C 786 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 YKL147CYKL147C 618 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 LTO1YNL260C 597 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 LIP5YOR196C 1245 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 YOR289WYOR289W 756 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 TIF5YPR041W 1218 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 PRP19YLL036C 1512 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 YLR345WYLR345W 1530 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 CAN1YEL063C 1773 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 TOD6YBL054W 1578 nt6.52□□□□□ -1.36
HDA2Q06629 YOR389WYOR389W 1875 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 UBC5YDR059C 447 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 CAF16YFL028C 870 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YGL260WYGL260W 231 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YLR118CYLR118C 684 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 RPS31YLR167W 459 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 CPR6YLR216C 1116 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 ORM2YLR350W 651 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 FSF1YOR271C 984 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 RRP15YPR143W 753 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 SEC18YBR080C 2277 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 FET3YMR058W 1911 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 MPA43YNL249C 1629 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 CLN2YPL256C 1638 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YJR096WYJR096W 849 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 MEU1YLR017W 1014 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 CCW12YLR110C 402 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YNL174WYNL174W 573 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 IES2YNL215W 963 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YPQ1YOL092W 927 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 ANT1YPR128C 987 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 RPO26YPR187W 468 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 KNS1YLL019C 2214 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 SLX5YDL013W 1860 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 UBC6YER100W 753 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 COG7YGL005C 840 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 ARG3YJL088W 1017 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YJL213WYJL213W 996 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 DAN1YJR150C 897 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 PTH2YBL057C 627 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YOR062CYOR062C 807 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 PYK2YOR347C 1521 nt6.5□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 TEC1YBR083W 1461 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 snR63snR63 255 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 OCA4YCR095C 1089 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YOX1YML027W 1158 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YML131WYML131W 1098 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 MBF1YOR298C-A 456 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YPL067CYPL067C 597 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 RFS1YBR052C 633 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YKR015CYKR015C 1707 nt6.49□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 HXT3YDR345C 1704 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YLH47YPR125W 1365 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YER134CYER134C 537 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 KSS1YGR040W 1107 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 MKK1YOR231W 1527 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 RAD7YJR052W 1698 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 RMD8YFR048W 1989 nt6.48□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 SEC24YIL109C 2781 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 YDL114WYDL114W 927 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 AIM6YDL237W 1173 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 GIC2YDR309C 1152 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 PET117YER058W 324 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 FMP48YGR052W 1110 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 CYS3YAL012W 1185 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 IZH4YOL101C 939 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 PRP2YNR011C 2631 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 URA7YBL039C 1740 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 CUS1YMR240C 1311 nt6.47□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 FLC2YAL053W 2352 nt6.46□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 SHE9YDR393W 1371 nt6.46□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 UGO1YDR470C 1509 nt6.46□□□□□ -1.37
HDA2Q06629 PTC1YDL006W 846 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 PRS2YER099C 957 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 SCEIQ0160 708 nt6.46□□□□□ -1.38
HDA2Q06629 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.4 ms