Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 EIS1YMR031C 2532 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 COX20YDR231C 618 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YIL060WYIL060W 435 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 CDC11YJR076C 1248 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 CAF40YNL288W 1122 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 MLC2YPR188C 492 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 GDA1YEL042W 1557 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 VBA1YMR088C 1689 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 DBP9YLR276C 1785 nt5.35□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 MNN2YBR015C 1794 nt5.35□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 IMG1YCR046C 510 nt5.35□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YJL171CYJL171C 1191 nt5.35□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 TAE1YBR261C 699 nt5.35□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 AAP1YHR047C 2571 nt5.34□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 UGX2YDL169C 672 nt5.34□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YDR053WYDR053W 396 nt5.34□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YDR187CYDR187C 519 nt5.34□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 CPA1YOR303W 1236 nt5.34□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 ERI1YPL096C-A 207 nt5.34□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YPR098CYPR098C 486 nt5.34□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 GAA1YLR088W 1845 nt5.34□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 HPF1YOL155C 2904 nt5.34□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YKL031WYKL031W 414 nt5.33□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YDR109CYDR109C 2148 nt5.33□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YMR122CYMR122C 375 nt5.32□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 TSR3YOR006C 942 nt5.32□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YOR111WYOR111W 699 nt5.32□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 APE3YBR286W 1614 nt5.32□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YML082WYML082W 1950 nt5.32□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YEL077CYEL077C 3834 nt5.31□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 CHL4YDR254W 1377 nt5.31□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YAP1801YHR161C 1914 nt5.31□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YDR015CYDR015C 240 nt5.31□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 SRY1YKL218C 981 nt5.31□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.31□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 IDP3YNL009W 1263 nt5.31□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 PDC1YLR044C 1692 nt5.31□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 SIA1YOR137C 1869 nt5.3□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YJL193WYJL193W 1209 nt5.3□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YMR295CYMR295C 594 nt5.3□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 PGA2YNL149C 390 nt5.3□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 TAH18YPR048W 1872 nt5.3□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 SEC12YNR026C 1416 nt5.3□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 ABZ1YNR033W 2364 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 VRP1YLR337C 2454 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 ERG1YGR175C 1491 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 SEC20YDR498C 1152 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YER010CYER010C 705 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 YME1YPR024W 2244 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 ASF2YDL197C 1578 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 PDH1YPR002W 1551 nt5.29□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 LEU5YHR002W 1074 nt5.28□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 AIM20YIL158W 615 nt5.28□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 ISN1YOR155C 1353 nt5.28□□□□□ -1.56
NEJ1Q06148 CST6YIL036W 1764 nt5.27□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 RSC2YLR357W 2670 nt5.27□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YDL129WYDL129W 876 nt5.27□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 UTP4YDR324C 2331 nt5.27□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 SHO1YER118C 1104 nt5.27□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 SOH1YGL127C 384 nt5.27□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 ECM3YOR092W 1842 nt5.27□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 ROG3YFR022W 2202 nt5.27□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 VPS1YKR001C 2115 nt5.26□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 HCR1YLR192C 798 nt5.26□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.26□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 JNM1YMR294W 1122 nt5.26□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YNL285WYNL285W 372 nt5.26□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 AMD1YML035C 2433 nt5.26□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 ATO3YDR384C 828 nt5.25□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 TFG2YGR005C 1203 nt5.25□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.25□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 SUE1YPR151C 621 nt5.25□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 HAP1YLR256W 4509 nt5.25□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 SSZ1YHR064C 1617 nt5.24□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YKR041WYKR041W 753 nt5.24□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 BAP2YBR068C 1830 nt5.24□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 GLO2YDR272W 825 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YDR396WYDR396W 501 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 PRS1YKL181W 1284 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 CIN4YMR138W 576 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YNL108CYNL108C 813 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 SCS22YBL091C-A 528 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YBR226CYBR226C 411 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YFL052WYFL052W 1398 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 RPT4YOR259C 1314 nt5.23□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 UTP18YJL069C 1785 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 HVG1YER039C 750 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 CDC43YGL155W 1131 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 YMR252CYMR252C 405 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 ODC2YOR222W 924 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 STL1YDR536W 1710 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 PAB1YER165W 1734 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 OSW2YLR054C 2175 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 RPT2YDL007W 1314 nt5.22□□□□□ -1.57
NEJ1Q06148 CDC1YDR182W 1476 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 NRD1YNL251C 1728 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YGL072CYGL072C 360 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 BUD32YGR262C 786 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 MPM1YJL066C 759 nt5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.7 ms