Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELAQ04206 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RELAQ04206 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RELAQ04206 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RELAQ04206 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RELAQ04206 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RELAQ04206 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RELAQ04206 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RELAQ04206 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELAQ04206 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RELAQ04206 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RELAQ04206 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RELAQ04206 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RELAQ04206 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RELAQ04206 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RELAQ04206 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RELAQ04206 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RELAQ04206 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RELAQ04206 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RELAQ04206 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RELAQ04206 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RELAQ04206 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RELAQ04206 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RELAQ04206 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RELAQ04206 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RELAQ04206 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RELAQ04206 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RELAQ04206 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RELAQ04206 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELAQ04206 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RELAQ04206 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RELAQ04206 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RELAQ04206 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RELAQ04206 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RELAQ04206 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RELAQ04206 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RELAQ04206 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RELAQ04206 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RELAQ04206 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RELAQ04206 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RELAQ04206 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RELAQ04206 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RELAQ04206 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RELAQ04206 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RELAQ04206 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RELAQ04206 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms