Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 YPR076WYPR076W 375 nt4.73□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 ECM31YBR176W 939 nt4.73□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 YRF1-4YLR466W 4149 nt4.73□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 YPL277CYPL277C 1464 nt4.73□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 IMA1YGR287C 1770 nt4.73□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 ARN2YHL047C 1863 nt4.73□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 VMA13YPR036W 1437 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 FRS2YFL022C 1512 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 YCK1YHR135C 1617 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 RPT3YDR394W 1287 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 YRB2YIL063C 984 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 PRS1YKL181W 1284 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 MRPS18YNL306W 654 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 SMF2YHR050W 1650 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 RAD3YER171W 2337 nt4.72□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 NUD1YOR373W 2556 nt4.71□□□□□ -1.65
PKR1Q03880 MFG1YDL233W 1377 nt4.71□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YDL057WYDL057W 987 nt4.71□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YOR343CYOR343C 327 nt4.71□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YMC1YPR058W 924 nt4.71□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 ARE2YNR019W 1929 nt4.71□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 PMT2YAL023C 2280 nt4.71□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 NRD1YNL251C 1728 nt4.7□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YER084WYER084W 387 nt4.7□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 SIP2YGL208W 1248 nt4.7□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt4.7□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 ASK1YKL052C 879 nt4.7□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YAR064WYAR064W 300 nt4.7□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 MRPL23YOR150W 492 nt4.7□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 TUL1YKL034W 2277 nt4.7□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 DPH2YKL191W 1605 nt4.69□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 SIT4YDL047W 936 nt4.69□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YNR040WYNR040W 771 nt4.69□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YPL062WYPL062W 405 nt4.69□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 PEX32YBR168W 1242 nt4.69□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 KKQ8YKL168C 2175 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 PPH21YDL134C 1110 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 URA3YEL021W 804 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 SSY5YJL156C 2100 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 SEC39YLR440C 2130 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 RHO2YNL090W 579 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 PPG1YNR032W 1107 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 HSP78YDR258C 2436 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 MKC7YDR144C 1791 nt4.68□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 AMD2YDR242W 1650 nt4.67□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 SML1YML058W 315 nt4.67□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 COX11YPL132W 903 nt4.67□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 PHO90YJL198W 2646 nt4.67□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 RAT1YOR048C 3021 nt4.67□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 SOG2YOR353C 2376 nt4.67□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 FET3YMR058W 1911 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 WTM2YOR229W 1404 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 IDP1YDL066W 1287 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 RME1YGR044C 903 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YML131WYML131W 1098 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YOL046CYOL046C 675 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YPR098CYPR098C 486 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 COX15YER141W 1461 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 EXG1YLR300W 1347 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 RPT4YOR259C 1314 nt4.66□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 ICL1YER065C 1674 nt4.65□□□□□ -1.66
PKR1Q03880 YDL121CYDL121C 450 nt4.65□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 UGX2YDL169C 672 nt4.65□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 CAX4YGR036C 720 nt4.65□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 POR2YIL114C 846 nt4.65□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 CYS3YAL012W 1185 nt4.65□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt4.65□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 GRS1YBR121C 2004 nt4.65□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 SEC12YNR026C 1416 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 KCH1YJR054W 1494 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 YER148W-AYER148W-A 579 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 YKL153WYKL153W 510 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 SPG4YMR107W 348 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 GAS3YMR215W 1575 nt4.64□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 VPS72YDR485C 2388 nt4.63□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 GPD1YDL022W 1176 nt4.63□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.63□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 YLR317WYLR317W 435 nt4.63□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 GYP1YOR070C 1914 nt4.63□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 COR1YBL045C 1374 nt4.63□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 DRS1YLL008W 2259 nt4.62□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 SNF3YDL194W 2655 nt4.62□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 YHR182WYHR182W 2358 nt4.62□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 RPL12AYEL054C 498 nt4.62□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 HOR7YMR251W-A 180 nt4.62□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 RBD2YPL246C 789 nt4.62□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 RPN7YPR108W 1290 nt4.62□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 AMD1YML035C 2433 nt4.62□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 HPF1YOL155C 2904 nt4.61□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 ECT1YGR007W 972 nt4.61□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 PUP2YGR253C 783 nt4.61□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 YKL031WYKL031W 414 nt4.61□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 YJU3YKL094W 942 nt4.61□□□□□ -1.67
PKR1Q03880 HSF1YGL073W 2502 nt4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.1 ms