Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNB1Q02641 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB1Q02641 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms