Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL18AQ02543 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms