Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1DQ01668 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1DQ01668 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1DQ01668 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms