Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F1Q01094 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F1Q01094 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms