Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSG6Q00889 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG6Q00889 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms