Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC1P78348 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC1P78348 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms