Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX1P78337 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX1P78337 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX1P78337 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX1P78337 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX1P78337 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX1P78337 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITX1P78337 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITX1P78337 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITX1P78337 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITX1P78337 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PITX1P78337 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITX1P78337 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PITX1P78337 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITX1P78337 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITX1P78337 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX1P78337 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITX1P78337 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PITX1P78337 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITX1P78337 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITX1P78337 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX1P78337 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITX1P78337 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITX1P78337 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITX1P78337 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITX1P78337 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITX1P78337 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITX1P78337 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITX1P78337 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PITX1P78337 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITX1P78337 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITX1P78337 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITX1P78337 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX1P78337 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX1P78337 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX1P78337 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX1P78337 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX1P78337 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX1P78337 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX1P78337 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX1P78337 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITX1P78337 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITX1P78337 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITX1P78337 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITX1P78337 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITX1P78337 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITX1P78337 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITX1P78337 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITX1P78337 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITX1P78337 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITX1P78337 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITX1P78337 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITX1P78337 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PITX1P78337 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITX1P78337 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITX1P78337 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX1P78337 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX1P78337 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX1P78337 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX1P78337 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX1P78337 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX1P78337 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX1P78337 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITX1P78337 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITX1P78337 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms