Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTXN1P60606 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTXN1P60606 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTXN1P60606 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTXN1P60606 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTXN1P60606 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN1P60606 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN1P60606 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN1P60606 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN1P60606 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN1P60606 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN1P60606 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN1P60606 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN1P60606 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN1P60606 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN1P60606 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN1P60606 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN1P60606 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN1P60606 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN1P60606 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN1P60606 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN1P60606 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN1P60606 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN1P60606 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN1P60606 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN1P60606 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN1P60606 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN1P60606 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN1P60606 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN1P60606 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN1P60606 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN1P60606 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTXN1P60606 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN1P60606 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.7 ms