Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC8A3P57103 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A3P57103 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A3P57103 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms