Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTBP2P56545 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms