Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPTEP56180 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTEP56180 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTEP56180 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTEP56180 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTEP56180 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTEP56180 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPTEP56180 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTEP56180 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTEP56180 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTEP56180 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPTEP56180 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TPTEP56180 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TPTEP56180 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTEP56180 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTEP56180 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTEP56180 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTEP56180 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTEP56180 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTEP56180 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTEP56180 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTEP56180 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTEP56180 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPTEP56180 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTEP56180 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTEP56180 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPTEP56180 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTEP56180 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPTEP56180 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPTEP56180 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPTEP56180 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPTEP56180 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPTEP56180 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTEP56180 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTEP56180 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTEP56180 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPTEP56180 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPTEP56180 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPTEP56180 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPTEP56180 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTEP56180 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTEP56180 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms