Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB3P54753 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB3P54753 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms