Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1B3P54709 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP1B3P54709 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP1B3P54709 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms