Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D1P54289 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D1P54289 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms