Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P54278 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P54278 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P54278 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P54278 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P54278 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P54278 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P54278 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P54278 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PMS2P54278 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS2P54278 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS2P54278 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS2P54278 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P54278 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P54278 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P54278 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P54278 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P54278 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P54278 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P54278 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P54278 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P54278 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P54278 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P54278 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P54278 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P54278 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS2P54278 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P54278 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P54278 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P54278 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P54278 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P54278 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P54278 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P54278 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P54278 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P54278 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P54278 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P54278 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P54278 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P54278 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P54278 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P54278 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P54278 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P54278 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P54278 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P54278 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P54278 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P54278 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms