Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRISP1P54107 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP1P54107 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms