Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA1P52294 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA1P52294 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA1P52294 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms