Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE6CP51160 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE6CP51160 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE6CP51160 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms