Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERFP50548 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERFP50548 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERFP50548 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERFP50548 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERFP50548 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERFP50548 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERFP50548 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERFP50548 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERFP50548 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERFP50548 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERFP50548 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERFP50548 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERFP50548 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERFP50548 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERFP50548 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERFP50548 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERFP50548 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERFP50548 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERFP50548 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERFP50548 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERFP50548 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERFP50548 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERFP50548 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERFP50548 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERFP50548 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERFP50548 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERFP50548 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERFP50548 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERFP50548 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERFP50548 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERFP50548 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERFP50548 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERFP50548 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERFP50548 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERFP50548 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERFP50548 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERFP50548 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms