Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMDP50402 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMDP50402 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMDP50402 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMDP50402 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMDP50402 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMDP50402 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMDP50402 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMDP50402 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMDP50402 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMDP50402 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMDP50402 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMDP50402 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMDP50402 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMDP50402 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMDP50402 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMDP50402 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMDP50402 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMDP50402 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMDP50402 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMDP50402 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMDP50402 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMDP50402 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMDP50402 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMDP50402 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMDP50402 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMDP50402 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMDP50402 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMDP50402 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMDP50402 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms