Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK3P49761 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK3P49761 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK3P49761 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK3P49761 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK3P49761 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK3P49761 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK3P49761 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK3P49761 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK3P49761 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK3P49761 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK3P49761 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK3P49761 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK3P49761 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK3P49761 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK3P49761 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK3P49761 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK3P49761 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK3P49761 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK3P49761 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK3P49761 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK3P49761 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK3P49761 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK3P49761 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK3P49761 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK3P49761 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK3P49761 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK3P49761 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK3P49761 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK3P49761 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK3P49761 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK3P49761 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK3P49761 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK3P49761 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK3P49761 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK3P49761 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK3P49761 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK3P49761 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK3P49761 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK3P49761 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK3P49761 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms