Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARS2P49590 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARS2P49590 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARS2P49590 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARS2P49590 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARS2P49590 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HARS2P49590 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HARS2P49590 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HARS2P49590 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARS2P49590 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARS2P49590 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARS2P49590 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARS2P49590 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARS2P49590 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HARS2P49590 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARS2P49590 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARS2P49590 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARS2P49590 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARS2P49590 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARS2P49590 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARS2P49590 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HARS2P49590 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARS2P49590 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARS2P49590 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARS2P49590 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARS2P49590 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARS2P49590 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARS2P49590 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARS2P49590 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARS2P49590 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HARS2P49590 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HARS2P49590 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARS2P49590 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HARS2P49590 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HARS2P49590 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARS2P49590 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARS2P49590 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARS2P49590 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARS2P49590 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARS2P49590 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARS2P49590 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARS2P49590 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARS2P49590 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARS2P49590 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARS2P49590 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARS2P49590 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HARS2P49590 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARS2P49590 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARS2P49590 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARS2P49590 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARS2P49590 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARS2P49590 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HARS2P49590 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HARS2P49590 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HARS2P49590 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARS2P49590 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HARS2P49590 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARS2P49590 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms