Protein–RNA interactions for Protein: P49585

PCYT1A, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1AP49585 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1AP49585 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCYT1AP49585 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms