Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPFP49454 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPFP49454 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPFP49454 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPFP49454 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPFP49454 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPFP49454 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPFP49454 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPFP49454 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPFP49454 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPFP49454 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPFP49454 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPFP49454 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPFP49454 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPFP49454 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPFP49454 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPFP49454 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPFP49454 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPFP49454 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPFP49454 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPFP49454 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPFP49454 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPFP49454 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPFP49454 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPFP49454 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPFP49454 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPFP49454 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPFP49454 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPFP49454 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPFP49454 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPFP49454 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPFP49454 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPFP49454 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPFP49454 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPFP49454 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPFP49454 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPFP49454 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPFP49454 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPFP49454 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPFP49454 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPFP49454 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPFP49454 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPFP49454 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPFP49454 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPFP49454 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPFP49454 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPFP49454 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPFP49454 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPFP49454 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPFP49454 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPFP49454 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPFP49454 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPFP49454 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPFP49454 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPFP49454 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPFP49454 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPFP49454 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPFP49454 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPFP49454 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPFP49454 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPFP49454 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPFP49454 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPFP49454 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPFP49454 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPFP49454 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPFP49454 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPFP49454 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms