Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX3P48380 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX3P48380 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX3P48380 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX3P48380 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX3P48380 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX3P48380 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX3P48380 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX3P48380 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX3P48380 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX3P48380 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX3P48380 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX3P48380 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX3P48380 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX3P48380 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX3P48380 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX3P48380 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX3P48380 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX3P48380 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX3P48380 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX3P48380 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX3P48380 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX3P48380 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX3P48380 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX3P48380 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX3P48380 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX3P48380 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX3P48380 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX3P48380 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX3P48380 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX3P48380 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX3P48380 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX3P48380 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX3P48380 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX3P48380 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX3P48380 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX3P48380 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX3P48380 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX3P48380 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX3P48380 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX3P48380 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX3P48380 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX3P48380 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX3P48380 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX3P48380 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX3P48380 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX3P48380 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX3P48380 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX3P48380 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX3P48380 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX3P48380 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX3P48380 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX3P48380 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX3P48380 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX3P48380 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX3P48380 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX3P48380 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX3P48380 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX3P48380 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX3P48380 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX3P48380 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX3P48380 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX3P48380 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX3P48380 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX3P48380 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX3P48380 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX3P48380 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX3P48380 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX3P48380 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX3P48380 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX3P48380 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX3P48380 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX3P48380 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX3P48380 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX3P48380 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX3P48380 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX3P48380 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX3P48380 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX3P48380 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms