Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL1P47992 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL1P47992 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL1P47992 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL1P47992 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL1P47992 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL1P47992 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL1P47992 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL1P47992 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL1P47992 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL1P47992 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL1P47992 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL1P47992 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL1P47992 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL1P47992 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL1P47992 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL1P47992 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL1P47992 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL1P47992 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL1P47992 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL1P47992 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms