Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGRP47804 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGRP47804 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGRP47804 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGRP47804 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGRP47804 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGRP47804 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGRP47804 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGRP47804 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGRP47804 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGRP47804 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGRP47804 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGRP47804 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGRP47804 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGRP47804 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGRP47804 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGRP47804 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGRP47804 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGRP47804 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGRP47804 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGRP47804 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGRP47804 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGRP47804 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGRP47804 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGRP47804 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGRP47804 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGRP47804 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGRP47804 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGRP47804 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGRP47804 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGRP47804 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGRP47804 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGRP47804 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGRP47804 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGRP47804 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGRP47804 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGRP47804 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGRP47804 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGRP47804 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGRP47804 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGRP47804 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGRP47804 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGRP47804 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGRP47804 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGRP47804 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGRP47804 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGRP47804 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGRP47804 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGRP47804 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RGRP47804 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGRP47804 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RGRP47804 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGRP47804 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RGRP47804 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGRP47804 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGRP47804 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGRP47804 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RGRP47804 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGRP47804 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGRP47804 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGRP47804 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RGRP47804 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGRP47804 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGRP47804 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGRP47804 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGRP47804 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGRP47804 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGRP47804 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGRP47804 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms