Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD4P46934 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD4P46934 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms