Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XCR1P46094 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XCR1P46094 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XCR1P46094 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XCR1P46094 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XCR1P46094 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XCR1P46094 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XCR1P46094 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XCR1P46094 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XCR1P46094 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XCR1P46094 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XCR1P46094 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XCR1P46094 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XCR1P46094 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XCR1P46094 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XCR1P46094 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XCR1P46094 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XCR1P46094 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XCR1P46094 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XCR1P46094 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XCR1P46094 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XCR1P46094 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XCR1P46094 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XCR1P46094 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XCR1P46094 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XCR1P46094 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XCR1P46094 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XCR1P46094 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XCR1P46094 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XCR1P46094 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XCR1P46094 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XCR1P46094 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XCR1P46094 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XCR1P46094 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XCR1P46094 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XCR1P46094 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XCR1P46094 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XCR1P46094 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XCR1P46094 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
XCR1P46094 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XCR1P46094 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XCR1P46094 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XCR1P46094 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XCR1P46094 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XCR1P46094 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XCR1P46094 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XCR1P46094 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XCR1P46094 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XCR1P46094 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XCR1P46094 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XCR1P46094 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XCR1P46094 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XCR1P46094 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XCR1P46094 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XCR1P46094 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XCR1P46094 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XCR1P46094 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XCR1P46094 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XCR1P46094 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XCR1P46094 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XCR1P46094 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XCR1P46094 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XCR1P46094 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XCR1P46094 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XCR1P46094 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XCR1P46094 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XCR1P46094 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XCR1P46094 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XCR1P46094 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XCR1P46094 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XCR1P46094 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XCR1P46094 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XCR1P46094 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XCR1P46094 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XCR1P46094 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XCR1P46094 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XCR1P46094 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XCR1P46094 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XCR1P46094 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XCR1P46094 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XCR1P46094 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XCR1P46094 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XCR1P46094 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XCR1P46094 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XCR1P46094 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms